Geografía
Orografía
Presenta una topografía plana. La única elevación se encuentra el sur del departamento, la cual es conocida con el nombre de Cerrito. En el departamento predominan las zonas bajas y planas lo cual favorece a la formación de esteros, lo que hace que en época de lluvia los ríos Paraguay, Tebicuary y el río Negro salgan de sus curso, provocando inundaciones y a consecuencia sea intransitables muchos lugares. El 70% del departamento está cubierto humedales.
Hidrografía
Ñeembucú se encuentra en el ángulo de los ríos Paraná y Paraguay. En el río Paraguay desembocan el río Negro, el arroyo Yacaré y otros. Los arroyos Ñeembucú y Hondo reciben las aguas de los Esteros Bellaco, Pegauho, Yacaremi, Po´i Tuyu Pyta, Camba, Mburicao-cué, entre otros.
Atardecer en el Río Paraguay.
Al norte del departamento se encuentran la Laguna Cabral, el Lago Ypoá, y Laguna Verá.
